中心組織
組織架構
本中心設置主任一人，綜理中心事務。中心設置有研究與行政兩部門，研究部門依研究方向分為四組，行政部門依業務發展需要分為兩組。研究部門各組分置組長一人、助理研究員與研究助理若干人。行政部門各組分置組長一人及職員若干人，負責各項行政業務之執行。
主要人力配置
第一組：海洋資源探勘與開發組
組長：莊偉良
現職：國立中山大學海洋環境及工程學系助理教授
學歷：美國德州農工大學土木及環境工程系博士
專長：海岸及海洋工程、流體衝擊結構物之互制作用、影像量化分析、精密流體量測、環境流體力學、計算流體力學
第二組：海洋生物技術與工程組
組長：林俊宏
現職：國立中山大學海洋環境及工程學系助理教授
學歷：國立交通大學博士
專長：海洋大地工程、工程地球物理、先進工程監檢測技術
第三組：海洋環境與生態組
組長：陸曉筠
現職：國立中山大學海洋環境及工程學系副教授
學歷：美國哈佛大學景觀設計博士
專長：空間規劃、環境規劃、海洋與海岸管理、GIS
第四組：海洋資源經營與管理組
組長：曾以帆
現職：國立中山大學海洋環境及工程學系副教授
學歷：國立成功大學水利及海洋工程系博士
專長：海岸開發與保護、海洋環境監測分析、海岸水動力模擬、水工模型試驗
第五組：行政業務組
組長：葉博弘
現職：國立中山大學海洋環境及工程學系助理教授
學歷：美國德州農工大學海洋工程系博士
專長：海洋工程、海事工程、浚渫工程、流體力學、渠道水力學、水利工程學、水工模型試驗
第六組：公關合作組
組長：邱永盛
現職：國立中山大學海下科技研究所副教授
學歷：國立台灣大學工程科學及海洋工程博士
專長：水下聲學、海洋音傳、地音反算、水下通訊